故事发生在1999年，那个不详的世纪之末。坐落在深山之中，由于不断的发生灵异事件(jiàn )而被称为“超自然学院”的私立学(xué )校里，迎来了它年(nián )轻(qīng )强势的新一任校长——神代玛雅（日笠(lì )阳子 配音）。绝对不相信有超自然力量存在的玛(mǎ )雅，此行便(biàn )是为了调查父亲里奇的死因而(ér )来，这样的她，遇见(jiàn )了一位名叫内田文明（水岛大宙 配音）的(de )神秘男子，刚刚登场的内田(tián )，便说出了让玛雅吃惊的话语，他(tā )居然来自未来的2012年！　　这个形迹可疑的男子的话能够相信吗？2012年的世界是怎样的景象？一连串意外让玛雅逐渐相信了内田的说辞，而内田究竟为何而(ér )回到过去，这原因也渐渐的浮出了水面。